CSRM,
Neste caso, normalmente, o servidor em estágio probatório, não pode desempenhar sua função entre outro poder (no caso o judiciário), estando tal previsão na maioria das Leis Orgânicas. Portanto, seria o caso de você verificar tal situação na Lei Orgânica de seu Município. Ainda, para você desempenhar sua função em outro Poder, verifique na Lei Orgânica também se não há necessidade de Autorização Legislativa e ainda há necessidade de haver um Termo de Convênio entre o Município e o Órgão do Judiciário ou no mínimo, um pedido do Juiz ou Promotor da Comarca solicitando servidor, até porque é obrigação do judiciário manter seu quadro funcional, não havendo obrigação nenhuma do município em designar servidores seus para prestar serviços em outro Poder. Ainda, tal designação tem que ser feita através de Portaria (ou Decreto, conforme o costume local) no qual se exponha as motivações (aquelas: CONSIDERANDO que...). Para futuro Mandado de Segurança faça requerimento pedindo explicações e documentos e procure um advogado aí na sua cidade que ele saberá os trâmites sequenciais. Abraços!